教學優勢
曙海教育的課程培養了大批受企業歡迎的工程師。大批企業和曙海
建立了良好的合作關系。曙海教育的課程在業內有著響亮的知名度。
本課程,秉承19年積累的教學品質,以項目實現為導向,老師將會與您分享設計的全流程以及工具的綜合使用經驗、技巧。
課程簡介:
DNASTAR培訓
DNASTAR是完整的序列分析軟件,用于分子生物學研究、蛋白質分析、基因組學和轉錄組學研究。
內容及介紹如下:
1、Adding sequence files for alignment in MegAlign Pro
介紹在執行比對之前添加和組織序列數據的不同方法,了解如何將不同的核苷酸和蛋白質序列加載到DNASTAR的MegAlign Pro應用程序中。
2、Choosing the best assembly strategy for your genomic sequencing data webinar
深入探討了基因組測序數據的不同組裝策略。DNASTAR高級產品經理Matthew Keyser幫助您確定何時使用不同的基于參考的和從頭開始的方法,以及如何執行各種拋光和校正技術來關閉基因組。組裝后,了解如何關閉缺口,并準備您的基因組序列進行注釋和下游分析。
3、Coloring a structure in Protean 3D according to features or properties
展示如何將表面應用于DNASTAR的Protean 3D軟件中的分子結構,如何為選定的特征著色,以及如何根據選定的生物物理或免疫遺傳特性為整個結構上色。
4、De novo assembly and analysis of Sanger_ABI data
了解如何快速輕松地組裝Sanger/ABI測序數據并進行下游分析。本視頻向您展示如何完成裝配設置,可視化,裝配編輯和修剪,并使用SeqMan Ultra BLAST搜索。
5、Exome Analysis Tutorial
了解如何在Lasergene Genomics中以無與倫比的輕松和速度將來自所有主要NGS平臺的外顯子組重測序數據與參考序列進行比對。全面的組裝后分析選項使識別和比較遺傳變異以及結構和非編碼變異變得容易。先進的基因過濾提供了確定變異對每個基因造成的破壞程度的能力。在本教程中,我們將向您展示完成NGS外顯子組分析所需的一切。
6、Fast ways to do multiple sequence alignment in MegAlign Pro
DNASTAR高級軟件工程師Andy Thomas展示了使用MegAlign Pro應用程序運行多序列比對的兩種非常快速的方法。MegAlign Pro是Lasergene分子生物學軟件包的一部分。
7、Gap closure after de novo assembly using SeqMan Ultra
了解如何在完成重新組裝后完成間隙閉合。本視頻將根據您的具體數據介紹三種不同的方法。
8、Get to know SeqMan Ultra
了解我們用于Sanger序列組裝和分析的最新應用程序SeqMan Ultra。憑借豐富的分析和可視化工具以及改進的算法,實現更快的組裝和更高的容量,看看為什么SeqMan Ultra是序列組裝和分析的新面孔。
9、How can DNASTAR's protein tools help you Webinar
展示如何使用綜合蛋白質工具來研究和建模新型冠狀病毒(2019-nCov)上的尖峰蛋白。作為演示的一部分,我們將向您展示如何將這些工具應用于您自己的數據,教您:
.分析蛋白質結構,進行結構比對,并為發表準備結構
.分析生物物理特性,預測蛋白質功能
.使用NovaFold蛋白質建模增強實驗蛋白質結構數據或從序列數據預測結構
10、Lasergene Genomics overview
Lasergene Genomics提供轉錄組和基因組測序數據的組裝、校準和分析所需的一切,所有這些都在一個集成的包中。我們支持傳統和下一代測序分析,以適應各種工作流程,因此您可以使用一個軟件包進行所有的NGS分析。
11、Learn SeqBuilder Pro’s annotation, primer, batch cloning and clone verification workflows
介紹了有關SeqBuilder Pro許多有用的工作流程的詳細信息。
12、Predict the 3D Structure of a Protein Using NovaFold AI
DNASTAR的NovaFold AI應用程序使用AlphaFold 2算法,根據蛋白質序列預測蛋白質的3D結構。
13、Quick assembly setup in SeqMan Ultra
了解如何使用SeqMan Ultra和SeqMan NGen為Sanger/ABI數據快速設置和運行程序集。如果使用的是單樣本數據,則可以快速添加序列并運行程序集,而無需指定程序集參數。
14、Quickly convert sequence files to a different file type
展示了如何使用SeqNinja應用程序在幾秒鐘內將一個或多個序列文件從一種文件類型轉換為另一種。SeqNinja包含在所有三個Lasergene軟件包中:分子生物學、蛋白質和基因組學。
15、Reference-guided Sanger sequence assembly in SeqMan Ultra 17.0 and 17.1
展示了如何在SeqMan Ultra 17.0和17.1中進行參考引導的Sanger序列組裝和分析。SeqMan Ultra是DNASTAR Lasergene軟件的一個組件。了解如何將多個樣本的Sanger/ABI數據與參考序列或基因組進行比對。使用SeqMan Ultra快速輕松地比較樣本,調查痕量和質量數據,并分析SNPs。
16、Reference-guided Sanger sequence assembly in SeqMan Ultra 17.2 and later
展示了如何在SeqMan Ultra 中進行參考引導的Sanger序列組裝和分析。SeqMan Ultra是DNASTAR的Lasergene軟件的一個組件。查看如何將Sanger/ABI數據與參考序列對齊。使用SeqMan Ultra快速輕松地比較樣本,調查痕量和質量數據,并分析SNPs。
17、RNA-Seq Analysis using Lasergene Genomics Webinar
NA-Seq數據分析對許多研究人員來說是一個挑戰,因為這項技術的應用非常廣泛。本視頻將演示如何使用Lasergene Genomics來獲取RNA序列數據的全貌。
18、RNA-Seq Project Set Up in SeqMan NGen
了解如何在SeqMan NGen (Lasergene Genomics的一部分)中使用復制建立RNA-Seq項目。
19、Supported File Types in MegAlign Pro
了解DNASTAR的MegAlign Pro應用程序支持的不同文件類型,包括fasta文件和GenBank文件。
20、Variant Annotation Database Tutorial
逐步展示了Lasergene針對人類樣本變體注釋的工作流程。首先在SeqMan NGen中進行序列組裝、變體檢測和樣本自動注釋,然后在ArrayStar中進行變體過濾和分析。
21、What's New in SeqMan Ultra 17.2
展示了Lasergene的SeqMan Ultra 17.2中的許多新功能,包括Sanger序列組裝,ABI序列修剪,導出對齊圖像等等。
練習
答疑