曙海教學優勢
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???????????????????????????????????第一天 |
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一、晶體結構導論 |
1.晶體及單晶結構分析發展與簡史及分析過程 2.晶體學基礎;點陣與對稱元素、等效點系、布拉維(Bravais)格子、點群與空間群 3.晶體物理基礎:群論基礎、對稱性與物理性質的關系、物性張量、不可約表示、 子群與相變 ? 4.結構解析理論基礎:直接法、charge flipping法、最小二乘精修 |
二、晶體結構解析與精修 |
一、晶體結構解析 1.1結構解析的過程與相角問題?1.2傅里葉合成?1.3帕特森方法?1.4直接法 1.5結構解析中的若干問題 二、晶體結構精修 2.1結構精修與最小二乘法??2.2權重方案與殘差因子?2.3精修技巧 2.4結構精修中的若干問題??2.5結構精修結果的檢查 |
三、單晶結構分析及繪圖 |
1.晶體學信息文件、數據庫與程序資源 1.1?CIF的定義與產生方法?1.2?CIF格式與檢查?1.3?CIF實例?1.4晶體學數據庫 1.5一些單晶結構分析及繪圖程序簡介 |
四、 SHELXTL程序與結構解析和精修 |
1.SHELXTL主要子程序簡介?2.XPREP模塊?3.XS模塊?4.XP:結構模型的檢查和修改 5.XL模塊6.XP:畫圖?7.XCIF模塊 (掌握Shelxtl單晶結構解析的基本方法和通用流程) 講解特殊結構的處理方法:Platon使用方法、雙晶和無序結構的處理、格子人工轉換 |
五、無序結構精修及實例應用 |
1.無序結構精修基本原理與方法??2.高氯酸根離子??3.環戊二烯基 4.混合配體的無序?5.苯環與烷基鏈的無序?6.DMF分子的兩重無序 7.金屬離子摻雜引起的無序 8.實例與訓練,掌握雙晶,非公度和四維調制結構的處理、無序與溫度因子的高階精修 ? |
????????????????????????????第二天 |
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六、Jana |
1.講解Jana各模塊使用方法:EditM50, Edit atoms, Edit profile, Structure solution, Refine等 2.實例講解與訓練,掌握Jana單晶結構解析的基本方法和通用流程 3.講解特殊結構理論:雙晶,非公度和四維調制結構(modulated structures)解析、無序與溫度因子高階精修 4.實例講解:掌握雙晶,非公度和四維調制結構的處理、無序與溫度因子的高階精修 |
七、Olex和Fullprof |
1.講解Olex使用方法,Olex解結構基本流程 2.講解Fullprof程序和各模塊的使用:WinPlotr, ??Edit PCR等 3.實例講解與訓練:掌握Fullprof的基本操作、粉末XRD峰的指標化、Retiveld精修 4.實例講解與訓練:粉末XRD法解結構 (針對問題:對于只知道大致結構模型和構筑單元,但沒有單晶衍射數據的化合物,如何通過粉末XRD譜的模擬退火算法得到單晶結構) |
八、結構解析實例 ? |
1.經典配合物與空間群P1?2.有機天然產物絕對結構(構型)的確定 3.外消旋化合物與手性空間群?4.含有多個分子的獨立單元 6.晶體結構與氫鍵及其表達?7.具有孔洞結構的配位聚合物?8.非缺面孿晶 9.用銅靶光源確定不含重原子的有機物絕對構型及金屬一有機物晶體的衍射數據 10.超低溫晶體衍射數據的收集 |